辅仁中学建于1918年，校名取自《论语》：“君子以文会友，以友辅仁。”建校伊始，辅仁中学即定“明道进德”为中文校训，定“live to learn learn to live”为英文校训，并坚持以延聘名师、精设课程、严格管理立校。早期辅仁中学设中文、西文两科，因教育质量高，西文科毕业可免试入读上海圣约翰大学。
1924年，由辅仁中学校董部筹资，在东门将军桥畔购地建造了自己的校舍。抗战期间，辅仁在上海租界租得校舍而复校，一直到抗战胜利。
1945年辅仁中学迁回无锡复校，1952年辅仁中学由国家接办，更名为无锡市第二中学。由于辅仁中学一贯保持教育的高质量，1960年获得了赴京参加全国文教战线群英会的殊荣。当年无锡市教育局向全市提出“学二中，超二中”的口号。
文革之后，辅仁中学迅速恢复教育秩序，奋力开创办学新局面。1982年辅仁中学被定为江苏省重点中学，1992年停办初中，由完中改为高级中学，1993年通过校友会创办民办辅仁中学（初中），1998年通过国家级示范高中的省级验收，2003年由二中复名为“辅仁”，2004年转评为江苏省四星级高中。
2008年，辅仁中学迎来建校九十周年庆典，近五千名校友回到母校参加纪念活动。2009年8月学校整体搬迁至风景秀丽、生态宜居的蠡湖之滨，占地158亩，建筑面积73300多平方米，地理位置优越，交通便捷，实行寄宿制管理。2009年学校荣获无锡市学校管理中心授予的“办学成果突出奖”和“办学绩效突出奖”。2010年还被市学校管理中心评为“2006—2010优质办学荣誉奖”。
进入新世纪，辅仁中学在德育工作、课程改革与师资队伍建设方面创出新特色，取得丰硕成果，先后获得江苏省文明单位标兵、江苏省德育先进学校、全国青少年科普创新示范学校等荣誉。
辅仁高级中学英才辈出，硕果累累，靠的是辅仁精神——关注学生个体生命发展的教育精神，为学与做人一致的人格精神，融通中西与融通文理的创新精神。明道进德，弘扬辅仁光荣传统；继往开来，再铸辅仁新的辉煌。
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